“紫雾”事件三年后，社会初步重建。在东海市的清河中学，年满16岁的学生集中进行异能觉醒仪式。绝大部分同学都成功觉醒，哪怕是最低的F级，而主角林默却成为全场唯一一个觉醒失败的普通人，从此被贴上“废物”的标签，开始遭受以秦霸天为首众人的嘲讽与欺凌。林默在一次放学后被秦霸天及其跟班堵在巷子里围殴。混乱中，他贴身佩戴的传家玉佩沾染了额头滴落的鲜血。在意识模糊之际，一道冰冷的声音在脑中响起：“文明传承系统激活，DNA绑定成功…开始扫描宿主…”。