燕云武林是一部以五代十国时期为背景的武侠小说。故事核心围绕主角成潇南后改名林潇南为师傅剑痴大侠复仇，青年侠客风清平守护绝世枪谱，并揭开了一桩横跨十余年的江湖阴谋。主角成潇南身中奇毒“凤凰丹”，得“毒手药王”上官莲救治，为保命被迫“去势”，并获传绝学，武功臻至化境。出谷后，成潇南携净空法师的血书追查真相。血书揭露了当今少林寺僧人净空实为上官莲之子上官云假扮，而十年前药王谷惨案、剑痴之死均是一场精心策划的阴谋，意在夺取药王手札中记载的半部邪功“五毒神掌”。成潇南在少林寺当众揭穿上官云，又与风清平合力推翻暴君。随着调查深入，所有线索指向势力庞大的侠客帮帮主庄长虹。庄长虹为练成“五毒神掌”一统武林，早年与毒手药王师妹陈氏勾结，血洗药王谷、陷害上官莲，后又为夺秘籍杀害燕山派掌门夏侯尚、大侠裘江鹤化身得一道人等人，并暗中扶植弑父篡位的朱友珪。最终，武功大成的林潇南与庄长虹展开惊天对决，虽成功击杀恶首，自己亦因毒伤与神功反噬而亡。其遗愿托付师姐“落英女侠”照料其子。故事在回忆往昔师徒三人的温馨练剑场景中结束，留下一个时代终结、传奇落幕的苍凉背影，以及对未来的一丝期许。